Activity
From 08.10.2021 to 06.11.2021
06.11.2021
- 23:09 Production #448: Стартовые системы
- Обновил модельку в pls_sl. Вроде должно быть ок. Возможно убил не всю ненужную воду.
05.11.2021
- 13:48 Production #448: Стартовые системы
- Что-то не так с complex_w.gro
gromacsplugin) Error reading atom 162228 from file, file does not match format
Obj...
04.11.2021
- 16:29 Production #448: Стартовые системы
- Сделал модели белков( плазмин, плазминоген и их комплексы со стрептокиназой). Пока ионы не добавлял, нужен опытный вз...
28.10.2021
- 18:25 Project #455 (In Progress): Гидролиз-активация плазмина
- Дай, пожалуйста, право на редактирование
Думаю, еще стоит добавить инфу о том, кто из них мутант, кто нет - 18:20 Project #455: Гидролиз-активация плазмина
- Таблица со структурами плазмина/плазминогена, организм - _Homo sapiens_.
Не ставила ограничений по разрешению, оно у...
18.10.2021
- 14:05 Exploration #457 (New): Обзор по гидролазам
- Возникла мысль о том, что весьма полезно было бы сделать крупный литературный обзор по гидролазам, который мог бы пом...
- 13:59 Production #448: Стартовые системы
- Так, супер-важное изменение. В будущем нам надо будет прочекать, какая структура стабильнее -
а) где Н-конец актива... - 13:55 Project #455: Гидролиз-активация плазмина
- Юля, как договаривались, передаю тебе этот тикет.
Папка, где я делал расчеты:
/home/domain/data/zlobin/2021/plasm...
11.10.2021
- 18:05 Project #455: Гидролиз-активация плазмина
- *Задание на неделю 11-18*
1.1. Посчитать в 3 повторностях динамики плазмина: Nneu-AspH и Nchg-Asp. CHARMM36m ибо в а... - 17:28 Project #455 (In Progress): Гидролиз-активация плазмина
- Часть отчетной кампании по Сириусу
Хотим пронаблюдать весь процесс между разрезанием активирующей петли и перестро...
10.10.2021
- 23:05 Production #448: Стартовые системы
- /home/domain/egor22366/plasmin/plasmin_sk/plasmin_sk_2/npt.gro
/home/domain/egor22366/plasmin/plasmin_sk/plasmin_sk_...
Also available in: Atom