Activity

From 10.10.2021 to 08.11.2021

08.11.2021

13:10 Production #448: Стартовые системы
/home/domain/egor22366/pls_sl/iter_2/complex_w.gro Egor Ilin

06.11.2021

23:09 Production #448: Стартовые системы
Обновил модельку в pls_sl. Вроде должно быть ок. Возможно убил не всю ненужную воду. Egor Ilin

05.11.2021

Avatar?id=882&size=24 13:48 Production #448: Стартовые системы
Что-то не так с complex_w.gro
gromacsplugin) Error reading atom 162228 from file, file does not match format
Obj...
Alexander Zlobin

04.11.2021

16:29 Production #448: Стартовые системы
Сделал модели белков( плазмин, плазминоген и их комплексы со стрептокиназой). Пока ионы не добавлял, нужен опытный вз... Egor Ilin

28.10.2021

Avatar?id=882&size=24 18:25 Project #455 (In Progress): Гидролиз-активация плазмина
Дай, пожалуйста, право на редактирование
Думаю, еще стоит добавить инфу о том, кто из них мутант, кто нет
Alexander Zlobin
Avatar?id=886&size=24 18:20 Project #455: Гидролиз-активация плазмина
Таблица со структурами плазмина/плазминогена, организм - _Homo sapiens_.
Не ставила ограничений по разрешению, оно у...
July Belyaeva

18.10.2021

Avatar?id=886&size=24 14:05 Exploration #457 (New): Обзор по гидролазам
Возникла мысль о том, что весьма полезно было бы сделать крупный литературный обзор по гидролазам, который мог бы пом... July Belyaeva
Avatar?id=882&size=24 13:59 Production #448: Стартовые системы
Так, супер-важное изменение. В будущем нам надо будет прочекать, какая структура стабильнее -
а) где Н-конец актива...
Alexander Zlobin
Avatar?id=882&size=24 13:55 Project #455: Гидролиз-активация плазмина
Юля, как договаривались, передаю тебе этот тикет.
Папка, где я делал расчеты:
/home/domain/data/zlobin/2021/plasm...
Alexander Zlobin

11.10.2021

Avatar?id=882&size=24 18:05 Project #455: Гидролиз-активация плазмина
*Задание на неделю 11-18*
1.1. Посчитать в 3 повторностях динамики плазмина: Nneu-AspH и Nchg-Asp. CHARMM36m ибо в а...
Alexander Zlobin
Avatar?id=882&size=24 17:28 Project #455 (In Progress): Гидролиз-активация плазмина
Часть отчетной кампании по Сириусу
Хотим пронаблюдать весь процесс между разрезанием активирующей петли и перестро...
Alexander Zlobin

10.10.2021

23:05 Production #448: Стартовые системы
/home/domain/egor22366/plasmin/plasmin_sk/plasmin_sk_2/npt.gro
/home/domain/egor22366/plasmin/plasmin_sk/plasmin_sk_...
Egor Ilin
 

Also available in: Atom