Activity

From 15.10.2021 to 13.11.2021

10:57 Production #448: Стартовые системы: *update gpu* дает больше всего прирост. Его надо использовать *всегда*, если есть гпу.
Остальные флаги включены. Р... Alexander Zlobin
10:46 Production #448 (In Progress): Стартовые системы: Используй tmux, чтобы создавать набор терминалов на сервере, которые будут работать, когда ты уже закроешь все со сво... Alexander Zlobin

16:17 Project #455: Гидролиз-активация плазмина: *Некоторые добавления по теории*
1) Статья: [[https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/pro.2532]]
Рассмат... July Belyaeva

01:14 Production #448: Стартовые системы: Продинамил плазминоген со стептокиназой. Проучилось 13.7 нс. Ставил на 20, но отключился терминал ( не знаю как это с... Egor Ilin

13:10 Production #448: Стартовые системы: /home/domain/egor22366/pls_sl/iter_2/complex_w.gro Egor Ilin

23:09 Production #448: Стартовые системы: Обновил модельку в pls_sl. Вроде должно быть ок. Возможно убил не всю ненужную воду. Egor Ilin

13:48 Production #448: Стартовые системы: Что-то не так с complex_w.gro
gromacsplugin) Error reading atom 162228 from file, file does not match format
Obj... Alexander Zlobin

16:29 Production #448: Стартовые системы: Сделал модели белков( плазмин, плазминоген и их комплексы со стрептокиназой). Пока ионы не добавлял, нужен опытный вз... Egor Ilin

18:25 Project #455 (In Progress): Гидролиз-активация плазмина: Дай, пожалуйста, право на редактирование
Думаю, еще стоит добавить инфу о том, кто из них мутант, кто нет Alexander Zlobin
18:20 Project #455: Гидролиз-активация плазмина: Таблица со структурами плазмина/плазминогена, организм - _Homo sapiens_.
Не ставила ограничений по разрешению, оно у... July Belyaeva

14:05 Exploration #457 (New): Обзор по гидролазам: Возникла мысль о том, что весьма полезно было бы сделать крупный литературный обзор по гидролазам, который мог бы пом... July Belyaeva
13:59 Production #448: Стартовые системы: Так, супер-важное изменение. В будущем нам надо будет прочекать, какая структура стабильнее -
а) где Н-конец актива... Alexander Zlobin
13:55 Project #455: Гидролиз-активация плазмина: Юля, как договаривались, передаю тебе этот тикет.
Папка, где я делал расчеты:
/home/domain/data/zlobin/2021/plasm... Alexander Zlobin

Also available in: Atom

Сириус - фибринолиз » Плазмин