Activity

From 21.08.2021 to 19.09.2021

18.09.2021

14:15 Плазмин Production #448: Стартовые системы
/home/domain/egor22366/plasmin/plasmin_solv_ions готовый файл плазмина. Во время добавления ионов я взял параметр neu... Egor Ilin

14.09.2021

Avatar?id=882&size=24 09:56 Фосфоглицерат мутаза Production #450 (In Progress): Стартовые системы
Подготовить стартовую систему комплекса PGM c двумя вариантами субстратов. Под стартовой системой подразумевается зал... Alexander Zlobin
Avatar?id=882&size=24 09:47 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе
В этом таске все же стоит попытаться найти хоть что-то про стереоселективность. Это могут быть очень древние статьи, ... Alexander Zlobin

09.09.2021

Avatar?id=975&size=24 01:36 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе
Только начнешь жаловаться, что все уже прочитал, так сразу что-нибудь находится еще. Но все равно не то.
_"Cofactor-...
Anastasia Rachkova
Avatar?id=975&size=24 00:43 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе
_"The Design and Synthesis of N-Xanthone Benzenesulfonamides as Novel Phosphoglycerate Mutase 1 (PGAM1) Inhibitors"(2... Anastasia Rachkova
Avatar?id=882&size=24 15:27 Плазмин Production #448: Стартовые системы
Результаты альфафолда. Забавно, что он фолдит стрептокиназу прямо как в кристалле, при том, что плазмин отсутствует. ... Alexander Zlobin

07.09.2021

17:58 Плазмин Production #448: Стартовые системы
Сделал стартовую систему. Лежит в папке home/domain/egor22366/plasmin/1_model_solv_ions.gro. В качетве mdp файла взял... Egor Ilin

05.09.2021

Avatar?id=975&size=24 19:19 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе
Пройти второй туториал и поискать статьи про стереоизомеры в активном центре фермента Anastasia Rachkova
Avatar?id=975&size=24 19:17 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе
Освоила статьи про моделирование и первый туториал громакса. Anastasia Rachkova

04.09.2021

Avatar?id=975&size=24 19:02 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе
Про фосфорилирование 26 Тирозина:
_"Molecular dynamics simulation reveals how phosphorylation of tyrosine 26 of phos...
Anastasia Rachkova

03.09.2021

Avatar?id=882&size=24 11:05 Плазмин Study #447: Подготовка к работе
https://go.drugbank.com/drugs/DB00086
"Streptokinase creates an active complex which promotes the cleavage of the ...
Alexander Zlobin
Avatar?id=882&size=24 10:57 Плазмин Production #448: Стартовые системы
Комплекс плазмина со стрептокиназой: 1BML (NB: Это неактивный искусственный мутант по кат. серину, S>A, надо вернуть ... Alexander Zlobin

26.08.2021

Avatar?id=975&size=24 21:47 Фосфоглицерат мутаза Study #435: Подготовка к работе
"Structure and mechanism of action of a novel phosphoglycerate mutase from Bacillus stearothermophilus" - про iPGM, у... Anastasia Rachkova
Avatar?id=882&size=24 11:23 Плазмин Production #448 (In Progress): Стартовые системы
Необходимо
1) Собрать все кристаллы плазмина и плазминогена на данный момент
2) Отсортировать по тому, что это за ф...
Alexander Zlobin
Avatar?id=882&size=24 11:20 Плазмин Study #447 (New): Подготовка к работе
До 15 сентября
1) Собрать подборку статей о структуре и функциях плазмина и том, что известно о его активации. Особо...
Alexander Zlobin
Avatar?id=882&size=24 11:17 Плазмин Project #446 (New): Байндинг-активация плазмина
Плазминоген должен быть связан сначала одним из байндинг-активаторов (фибрин, стрепто/стафилокиназа, рецептор урокина... Alexander Zlobin
 

Also available in: Atom