Activity

From 28.09.2021 to 27.10.2021

27.10.2021

Avatar?id=882&size=24 12:24 Production #450: Стартовые системы
Привет, апдейтни по подготовке систем, пожалуйста. Когда смогу их посмотреть и обсудить?
И следи за своевременным об...
Alexander Zlobin

11.10.2021

Avatar?id=975&size=24 21:17 Production #450: Стартовые системы
Взяла новое поле и пофиксила глутамин 38 (pdbfixer'ом), команда:
_gmx pdb2gmx -ff amber19sb -f 3ezn.pdb -o 3ezn_proc...
Anastasia Rachkova

07.10.2021

Avatar?id=882&size=24 15:09 Production #450 (In Progress): Стартовые системы
Такс
Во-первых, поле 03 очень древнее - на это намекает цифра 03, то бишь 2003 год. Что брать - ff19sb. Как это де...
Alexander Zlobin
Avatar?id=975&size=24 04:03 Production #450: Стартовые системы
За основу фермента взяла белок из 3EZN буркходелии, очистила его от воды и гликолей.
Хотела бахнуть pdb2gmx (поле am...
Anastasia Rachkova
Avatar?id=975&size=24 03:03 Production #450: Стартовые системы
Сделаны параметры для субстратов - обоих стереоизомеров. Далее нужно
1) сделать системы комплексов
2) сделать мини...
Anastasia Rachkova

01.10.2021

Avatar?id=975&size=24 13:13 Production #450: Стартовые системы
Решено пока оставить Bespoke-fit в покое и сделать все с помощью GAFF. Anastasia Rachkova
 

Also available in: Atom