Activity

From 03.10.2021 to 01.11.2021

14:25 Production #450: Стартовые системы: Спасибо! pdb сделала, двигаюсь дальше. Anastasia Rachkova

17:51 Production #450: Стартовые системы: Режим editing в Pymol
Ctrl + ПКМ, щелчок по связи и зажать - будет вращение той группы, к которой ближе вы щелкнули. Alexander Zlobin
03:06 Production #450: Стартовые системы: У меня какой-то фейл с тем, чтобы вращать остатки амидов, делаю это не по-русски. Вы не подскажете еще раз, пожалуйст... Anastasia Rachkova

09:48 Production #450: Стартовые системы: Подготовка корректных систем - половина успешности моделирования, так что да, каким бы ни было унылым, делать приходи... Alexander Zlobin

01:21 Production #450: Стартовые системы: У меня небыстро продвигается с ручной обработкой гистидинов и аспарагинов с глутаминами. Хочу к 30 ноября доделать на... Anastasia Rachkova
12:24 Production #450: Стартовые системы: Привет, апдейтни по подготовке систем, пожалуйста. Когда смогу их посмотреть и обсудить?
И следи за своевременным об... Alexander Zlobin

21:17 Production #450: Стартовые системы: Взяла новое поле и пофиксила глутамин 38 (pdbfixer'ом), команда:
_gmx pdb2gmx -ff amber19sb -f 3ezn.pdb -o 3ezn_proc... Anastasia Rachkova

15:09 Production #450 (In Progress): Стартовые системы: Такс
Во-первых, поле 03 очень древнее - на это намекает цифра 03, то бишь 2003 год. Что брать - ff19sb. Как это де... Alexander Zlobin
04:03 Production #450: Стартовые системы: За основу фермента взяла белок из 3EZN буркходелии, очистила его от воды и гликолей.
Хотела бахнуть pdb2gmx (поле am... Anastasia Rachkova
03:03 Production #450: Стартовые системы: Сделаны параметры для субстратов - обоих стереоизомеров. Далее нужно
1) сделать системы комплексов
2) сделать мини... Anastasia Rachkova

Also available in: Atom