Activity
From 23.12.2021 to 21.01.2022
10.01.2022
- 19:21 Production #450: Стартовые системы
- Для S-изомера все получилось, с ним работала в новой папке
/home/domain/rachkovanastya/PGM_S_start
- 17:59 Production #450: Стартовые системы
- Переделала все еще раз, подкорректировала воду, в который сомневалась в прошлый раз. Но снова при запуске gmx mdrun -...
09.01.2022
- 02:35 Production #450: Стартовые системы
- Что есть:
прочитала статьи.
для R-изомера еще раз заново сделала файл белка, поправила руками Asn, Gln, His. Сделал...
03.01.2022
- 15:50 Production #450: Стартовые системы
- При выполнении
*gmx grompp -f em.mdp -c 3GP5_ions.gro -p topol.top -o em.tpr*
возникла сдедующая ошибка:
Fatal er...
29.12.2021
- 12:13 Production #450: Стартовые системы
- Важные моменты:
В файле complex.gro лучше сразу ставить атомы лиганда сразу после белка и перед водой, все атомы дол...
25.12.2021
- 16:35 Production #450: Стартовые системы
- Этот момент в файле вроде не касается даже аминоксилот и прочего, но я как-то не рискнула просто удалить эту строчку ...
- 16:31 Production #450: Стартовые системы
- Добрый вечер!
Я продвинулась дальше, но снова наткнулась на неочевидную ошибку при запуске команды:
gmx grompp -f ...
Also available in: Atom