Project #419
Второй металл и протоны в AmiN
Status: | New | Start date: | 03.05.2021 | ||
---|---|---|---|---|---|
Priority: | Normal | Due date: | 01.11.2021 | ||
Assignee: | Alexander Zlobin | % Done: | 83% | ||
Category: | - | ||||
Target version: | - |
Description
По механизму работы AmiN киназы остались вопросы. Так, не понятно, почему не связывается второй металл (или связывается плохо) - в окружении нет ничего мешающего. В hAmiN он отлично связывается, а в этом месте киназы очень похожи. Гипотеза: в AmiN происходит протонирование АТФ. Мы хотим выяснить, как на самом деле выглядит активный центр в предреакционном состоянии с учетом всех протонов. Наши критерии в порядке значимости:
1) Соответствие конформации из кристалла в механике во времени
2) Возможность протекания реакции
3) Плохое связывание второго металла
Subtasks