Activity

From 21.04.2021 to 20.05.2021

16:14 Production #420 (New): Динамики с ATP: Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ATP и его протонированными вариантами. Alexander Zlobin
16:12 Project #419 (New): Второй металл и протоны в AmiN: По механизму работы AmiN киназы остались вопросы. Так, не понятно, почему не связывается второй металл (или связывает... Alexander Zlobin
12:22 Production #395 (In Progress): Параметризация AMP-PNP: July Belyaeva

20:21 Production #395: Параметризация AMP-PNP: h3. Шаги работы для получения зарядов
1. Структуры AMP-PNP, AMP-PNP-h, и двух хвостов нарисовать в авогадро. Присв... Alexander Zlobin
14:28 Production #395: Параметризация AMP-PNP: Нужно дополнительное напоминание о процедуре запуска *RESP* (ранее этого не делала) на одном примере.
Также нужны... July Belyaeva
14:56 Exploration #406 (In Progress): Отбор систем-кандидатов (предреакционное состояние): Была написана функция, которая обрабатывает pdb-файлы посчитанных 60 систем и считает для них ряд геометрических пара... July Belyaeva

14:12 Production #397 (Resolved): Подготовка систем: Аккуратно и, по возможности, автоматизированно собрать системы.
Металлы:
* Mg
* MgLi
* MgMg
Фосфат:
* AMP... Alexander Zlobin
14:09 Production #396 (New): Динамики с ANP-PNP: Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ANP-PNP и его протонированными вариантами. Alexander Zlobin
14:06 Production #395 (Resolved): Параметризация AMP-PNP: Есть основания полагать, что никакой из 60 паттернов протонирования/металлирования активного центра не может быть пох... Alexander Zlobin

Also available in: Atom