Activity
From 26.04.2021 to 25.05.2021
20.05.2021
- 16:14 Production #420 (New): Динамики с ATP
- Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ATP и его протонированными вариантами.
- 16:12 Project #419 (New): Второй металл и протоны в AmiN
- По механизму работы AmiN киназы остались вопросы. Так, не понятно, почему не связывается второй металл (или связывает...
- 12:22 Production #395 (In Progress): Параметризация AMP-PNP
04.05.2021
- 20:21 Production #395: Параметризация AMP-PNP
- h3. Шаги работы для получения зарядов
1. Структуры AMP-PNP, AMP-PNP-h, и двух хвостов нарисовать в авогадро. Присв... - 14:28 Production #395: Параметризация AMP-PNP
- Нужно дополнительное напоминание о процедуре запуска *RESP* (ранее этого не делала) на одном примере.
Также нужны... - 14:56 Exploration #406 (In Progress): Отбор систем-кандидатов (предреакционное состояние)
- Была написана функция, которая обрабатывает pdb-файлы посчитанных 60 систем и считает для них ряд геометрических пара...
03.05.2021
- 14:12 Production #397 (Resolved): Подготовка систем
- Аккуратно и, по возможности, автоматизированно собрать системы.
Металлы:
* Mg
* MgLi
* MgMg
Фосфат:
* AMP... - 14:09 Production #396 (New): Динамики с ANP-PNP
- Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ANP-PNP и его протонированными вариантами.
- 14:06 Production #395 (Resolved): Параметризация AMP-PNP
- Есть основания полагать, что никакой из 60 паттернов протонирования/металлирования активного центра не может быть пох...
Also available in: Atom