Activity

From 26.04.2021 to 25.05.2021

20.05.2021

Avatar?id=882&size=24 16:14 Production #420 (New): Динамики с ATP
Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ATP и его протонированными вариантами. Alexander Zlobin
Avatar?id=882&size=24 16:12 Project #419 (New): Второй металл и протоны в AmiN
По механизму работы AmiN киназы остались вопросы. Так, не понятно, почему не связывается второй металл (или связывает... Alexander Zlobin
Avatar?id=886&size=24 12:22 Production #395 (In Progress): Параметризация AMP-PNP
July Belyaeva

04.05.2021

Avatar?id=882&size=24 20:21 Production #395: Параметризация AMP-PNP
h3. Шаги работы для получения зарядов
1. Структуры AMP-PNP, AMP-PNP-h, и двух хвостов нарисовать в авогадро. Присв...
Alexander Zlobin
Avatar?id=886&size=24 14:28 Production #395: Параметризация AMP-PNP
Нужно дополнительное напоминание о процедуре запуска *RESP* (ранее этого не делала) на одном примере.
Также нужны...
July Belyaeva
Avatar?id=886&size=24 14:56 Exploration #406 (In Progress): Отбор систем-кандидатов (предреакционное состояние)
Была написана функция, которая обрабатывает pdb-файлы посчитанных 60 систем и считает для них ряд геометрических пара... July Belyaeva

03.05.2021

Avatar?id=882&size=24 14:12 Production #397 (Resolved): Подготовка систем
Аккуратно и, по возможности, автоматизированно собрать системы.
Металлы:
* Mg
* MgLi
* MgMg
Фосфат:
* AMP...
Alexander Zlobin
Avatar?id=882&size=24 14:09 Production #396 (New): Динамики с ANP-PNP
Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ANP-PNP и его протонированными вариантами. Alexander Zlobin
Avatar?id=882&size=24 14:06 Production #395 (Resolved): Параметризация AMP-PNP
Есть основания полагать, что никакой из 60 паттернов протонирования/металлирования активного центра не может быть пох... Alexander Zlobin
 

Also available in: Atom