Киназы антибиотикорезистентности

31.05.2021

17:09 Production #395: Параметризация AMP-PNP

*Пути до файлов с топологией*:
1) /home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/amp-pnp/parameterize/parameters/GAFF2/... July Belyaeva

16:56 Production #395: Параметризация AMP-PNP

*Слияние топологий*:
- в файле /home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/*amp-pnp*/parameterize/parameters/GAFF2/m... July Belyaeva

12:11 Production #395: Параметризация AMP-PNP

*Запуск parameterize для amp-pnp и amp-pnph производится со следующими параметрами*:
> parameterize Mol_m1-o1.mol2 -... July Belyaeva

20.05.2021

16:14 Production #420 (New): Динамики с ATP

Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ATP и его протонированными вариантами. Alexander Zlobin

16:12 Project #419 (New): Второй металл и протоны в AmiN

По механизму работы AmiN киназы остались вопросы. Так, не понятно, почему не связывается второй металл (или связывает... Alexander Zlobin

12:22 Production #395 (In Progress): Параметризация AMP-PNP

July Belyaeva