Activity
From 16.05.2021 to 14.06.2021
14.06.2021
- 23:14 Production #397: Подготовка систем
- *.gro всех систем*:
/home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/systems-gro/
*Системы*:
/home/domain/data/julyb...
31.05.2021
- 17:09 Production #395: Параметризация AMP-PNP
- *Пути до файлов с топологией*:
1) /home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/amp-pnp/parameterize/parameters/GAFF2/... - 16:56 Production #395: Параметризация AMP-PNP
- *Слияние топологий*:
- в файле /home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/*amp-pnp*/parameterize/parameters/GAFF2/m... - 12:11 Production #395: Параметризация AMP-PNP
- *Запуск parameterize для amp-pnp и amp-pnph производится со следующими параметрами*:
> parameterize Mol_m1-o1.mol2 -...
20.05.2021
- 16:14 Production #420 (New): Динамики с ATP
- Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ATP и его протонированными вариантами.
- 16:12 Project #419 (New): Второй металл и протоны в AmiN
- По механизму работы AmiN киназы остались вопросы. Так, не понятно, почему не связывается второй металл (или связывает...
- 12:22 Production #395 (In Progress): Параметризация AMP-PNP
Also available in: Atom