Activity

From 17.05.2021 to 15.06.2021

13:32 Production #397: Подготовка систем: *Системы (белок+амикумацин+amp-pnp+ионы) лежат по следующему пути*:
/home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/syst... July Belyaeva
09:38 Production #397: Подготовка систем: Обновлю порядок атомов в itp для амикумация и amp-pnp July Belyaeva

23:14 Production #397: Подготовка систем: *.gro всех систем*:
/home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/systems-gro/
*Системы*:
/home/domain/data/julyb... July Belyaeva

17:09 Production #395: Параметризация AMP-PNP: *Пути до файлов с топологией*:
1) /home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/amp-pnp/parameterize/parameters/GAFF2/... July Belyaeva
16:56 Production #395: Параметризация AMP-PNP: *Слияние топологий*:
- в файле /home/domain/data/julybel/amin-2021/AMP-PMP/*amp-pnp*/parameterize/parameters/GAFF2/m... July Belyaeva
12:11 Production #395: Параметризация AMP-PNP: *Запуск parameterize для amp-pnp и amp-pnph производится со следующими параметрами*:
> parameterize Mol_m1-o1.mol2 -... July Belyaeva

16:14 Production #420 (New): Динамики с ATP: Нужно подготовить системы и прогнать динамики с ATP и его протонированными вариантами. Alexander Zlobin
16:12 Project #419 (New): Второй металл и протоны в AmiN: По механизму работы AmiN киназы остались вопросы. Так, не понятно, почему не связывается второй металл (или связывает... Alexander Zlobin
12:22 Production #395 (In Progress): Параметризация AMP-PNP: July Belyaeva

Also available in: Atom