Activity

From 29.09.2021 to 28.10.2021

09:48 Production #450: Стартовые системы: Подготовка корректных систем - половина успешности моделирования, так что да, каким бы ни было унылым, делать приходи... Alexander Zlobin

01:21 Production #450: Стартовые системы: У меня небыстро продвигается с ручной обработкой гистидинов и аспарагинов с глутаминами. Хочу к 30 ноября доделать на... Anastasia Rachkova
12:24 Production #450: Стартовые системы: Привет, апдейтни по подготовке систем, пожалуйста. Когда смогу их посмотреть и обсудить?
И следи за своевременным об... Alexander Zlobin

21:17 Production #450: Стартовые системы: Взяла новое поле и пофиксила глутамин 38 (pdbfixer'ом), команда:
_gmx pdb2gmx -ff amber19sb -f 3ezn.pdb -o 3ezn_proc... Anastasia Rachkova

15:09 Production #450 (In Progress): Стартовые системы: Такс
Во-первых, поле 03 очень древнее - на это намекает цифра 03, то бишь 2003 год. Что брать - ff19sb. Как это де... Alexander Zlobin
04:03 Production #450: Стартовые системы: За основу фермента взяла белок из 3EZN буркходелии, очистила его от воды и гликолей.
Хотела бахнуть pdb2gmx (поле am... Anastasia Rachkova
03:03 Production #450: Стартовые системы: Сделаны параметры для субстратов - обоих стереоизомеров. Далее нужно
1) сделать системы комплексов
2) сделать мини... Anastasia Rachkova

13:13 Production #450: Стартовые системы: Решено пока оставить Bespoke-fit в покое и сделать все с помощью GAFF. Anastasia Rachkova

Also available in: Atom